引起女性月经性阴道炎是因为阴道的环境经常受到宿主的代谢产物、细菌本身的产物及外源性因素而不稳定。病原体有2种来源，即来自原本寄生于阴道内的菌群和来自外界入侵的病原体。
内部原因
阴道菌群非常复杂，除原虫、真菌外，尚包括很多需氧菌及厌氧菌，这些微生物可分为共栖的及病理性的，都生长在一个共同的环境内，各微生物之间可能有拮抗作用；另一个影响其生长的是氢离子浓度，在pH3.8～4.2时，有利于共栖菌的繁殖，尤其是乳酸杆菌，这是健康阴道中的主要菌种，当月经来时，这种平衡被破坏，互相制约作用消失，所以氢离子浓度下降，乳酸杆菌失去优势，病理菌得以繁殖，就产生阴道炎的症状。
外部原因
月经期内分泌激素发生变化，破坏了阴道的生态平衡时，这些常住的菌群会变成致病菌，冲破阴道屏障而引起感染；女性经期没有经常换卫生巾或者卫生巾质量不佳也会会造成月经性阴道炎；女性在月经期间不注意个人卫生，或经期进行性行为，或经期进行坐浴等，也会导致阴部受到污染，进而出现炎症。
