有一些生殖道慢性感染被认为是早期流产的原因之一。能引起反复流产的病原体往往是持续存在于生殖道而母体很少产生症状，而且此病原体能直接或间接导致胚胎死亡。生殖道逆行感染一般发生在妊娠12周以前，过此时期，胎盘与蜕膜融合，构成机械屏障，而且随着妊娠进程，羊水抗感染力也逐步增强，感染的机会减少。
1、细菌感染：布鲁菌属（Brucella）和弧菌属（campylobaeteria）感染可导致动物（牛、猪、羊等）流产，但在人类还不肯定。有人认为李司忒菌（List？eftamonocytogens）与相关性流产有一定的关系，但缺乏确切的证据。
2、沙眼衣原体（chlamydiatrachomatis）报道，妊娠期沙眼衣原体感染率为3％-30％否直接导致流产尚无定论。
3、支原体：流产患者宫颈及流产物中支原体的阳性率均较高，血清学上也支持人支原体（myco？plasmahominis）和解脲支原体（ureaplasma urealytic？am）与流产有关。
4、弓形虫（toxoplasma）：弓形虫感染引起的流产是散发的，与习惯性流产的关系尚未完全证明。
5、病毒感染：巨细胞病毒（cytomegalo virus）经胎盘叮累及胎儿，引起心血管系统和神经系统畸形，致死或流产。妊娠前半期单纯疱疹（herpes sim—plex）感染流产发生率可高达70％，即使不发生流产，也易累及胎儿、新生儿。妊娠初期风疹病毒（rubellavirus）感染者流产的发生率较高。人免疫缺陷病毒（humanimmunodeficiencyvirus，HIV）感染与流产密切相关，Temmerman等报道，HIV-l抗体阳性是流产的独立相关因素。
